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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
05/11/2021 |
Data da última atualização: |
05/11/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OKINO, C. H.; CAMINOTTO, L. C. F.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; NICIURA, S. C. M.; ESTEVES, S. N.; SANTOS, I. B. DOS; TOSCANO, J. H. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. |
Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; LARA CRISTINA FRIZONI CAMINOTTO, UNICEP; RAFAELA TAMI IKEDA KAPRITCHKOFF, UNESP; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; SERGIO NOVITA ESTEVES, CPPSE; ISABELLA BARBOSA DOS SANTOS, UNESP; JOAO HENRIQUE BARBOSA TOSCANO, UNESP; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
Título: |
Comparison of ovine B-globin haplotype sequences and a new multiplex PCR for identification. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Veterinary Parasitology, v.300, 109592, dec. 2021. |
Páginas: |
5 p. |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2021.109592 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Deletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents costs (less than a half price) and wider reachability, since even labs without real time PCR thermocyclers are able to offer this assay. Therefore, it may become an important tool for sheep producers to improve genetic selection of parasite resistant animals. MenosDeletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents co... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Allele; B haplotype; Beta globin C; Morada Nova; Resistance. |
Thesaurus Nal: |
Sheep. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02671naa a2200313 a 4500 001 2135834 005 2021-11-05 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.vetpar.2021.109592$2DOI 100 1 $aOKINO, C. H. 245 $aComparison of ovine B-globin haplotype sequences and a new multiplex PCR for identification.$h[electronic resource] 260 $c2021 300 $a5 p. 520 $aDeletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents costs (less than a half price) and wider reachability, since even labs without real time PCR thermocyclers are able to offer this assay. Therefore, it may become an important tool for sheep producers to improve genetic selection of parasite resistant animals. 650 $aSheep 653 $aAllele 653 $aB haplotype 653 $aBeta globin C 653 $aMorada Nova 653 $aResistance 700 1 $aCAMINOTTO, L. C. F. 700 1 $aKAPRITCHKOFF, R. T. I. 700 1 $aNICIURA, S. C. M. 700 1 $aESTEVES, S. N. 700 1 $aSANTOS, I. B. DOS 700 1 $aTOSCANO, J. H. B. 700 1 $aOLIVEIRA, M. C. de S. 700 1 $aCHAGAS, A. C. de S. 773 $tVeterinary Parasitology$gv.300, 109592, dec. 2021.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 115 | |
101. | | MARTINS, C. A. O.; SEDIYAMA, C. S.; MOREIRA, M. A.; REIS, M. S.; ROCHA, V. S.; OLIVEIRA, M. G. de A. Efeito da eliminação genética das lipoxigenases das sementes sobre as características agronômicas da soja. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 10, p. 1389-1398, out. 2002 Título em inglês: Effect of genetic elimination of seed lipoxygenases on agronomic characteristics of soybean.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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102. | | OLIVEIRA, M. G.; NEVES, M. B. das; TRECHA, C. de O.; CUNHA, U. S.; GRÜTZMACHER, A. D.; MARTINS, J. F. da S.; PORTO, M. P. Efeito de espinosade sob diferentes dosagens e da associação de enxofre com inseticidas no controle da lagarta-do-cartucho em milho de várzea. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE MILHO, 53., REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE SORGO, 36., 2008. Pelotas. Atas e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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103. | | BASSINELLO, P. Z.; OLIVEIRA, M. G. de C.; RODRIGUES, L. L.; SOARES, D. M.; DEL PELOSO, M. J.; SILVA, C. C. da; THUNG, M. Decoada e outros químicos para reduzir o tempo de cocção e seus efeitos na qualidade culinária de feijão. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 2. p. 691-694. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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104. | | RODRIGUES, J. M.; COUTINHO, F. S.; SANTOS, D. S. dos; VITAL, C. E.; RAMOS, J. R. L. S.; REIS, P. B.; OLIVEIRA, M. G. A.; REIS, A. M. dos; FONTES, E. P. B.; RAMOS, H. J. O. BiP-overexpressing soybean plants display accelerated hypersensitivity response (HR) affecting the SA-dependent sphingolipid and flavonoid pathways. Phytochemistry (Oxford), v. 185, article 112704, 2021. Na publicação: Angela Mehta.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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105. | | MONTEIRO, L. P.; SILVA JÚNIOR, N. R.; VITAL, C. E.; BARROS, R. A.; BARROS, E.; AUAD, A. M.; PEREIRA, J. F.; RAMOS, H. J. de O.; OLIVEIRA, M. G. de A. Protein and phytohormone profiles of Mahanarva spectabilis salivary glands infesting different forages. Archives of Insect Biochemistry and Physiology, v. 106, e21773, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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106. | | OLIVEIRA, M. G. de C.; OLIVEIRA, L. F. C. de; WENDLAND, A.; GUIMARÃES, C. M.; QUINTELA, E. D.; BARBOSA, F. R.; CARVALHO, M. da C. S.; LOBO JUNIOR, M.; SILVEIRA, P. M. da. Conhecendo a fenologia do feijoeiro e seus aspectos fitotécnicos. Brasília, DF: Embrapa, 2018. 59 p. il.Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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107. | | SARAIVA, N. B.; EMIDIO, N. B.; VITAL, C. E.; GUSMÃO, M. A. N.; MARCONATO, D. G.; COUTINHO, F. S.; PEREIRA, J. F.; AUAD, A. M.; FARIA-PINTO, P.; RAMOS, H. J. O.; OLIVEIRA, M. G. A. Molecular profiling of the Mahanarva spectabilis salivary glands and phytohormonal response of elephant grass. International Journal of Tropical Insect Science, v. 41, p. 849-860, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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108. | | WANDER, A. E.; SILVA, O. F. da; BARRIGOSSI, J. A. F.; FERREIRA, C. M.; LANNA, A. C.; MELO, L. C.; NICOLI, C. M. L.; SOARES, D. M.; OLIVEIRA, M. G. de C.; SANTIAGO, C. M. Impactos econômicos, sociais e ambientais da cultivar de feijoeiro comum BRS Pontal na 3a. safra no Brasil Central, 2008 a 2010. In: REUNIÃO DE BIOFORTIFICAÇÃO NO BRASIL, 4., 2011. Teresina. Palestras e resumos... Rio de Janeiro: Embrapa Agroindústria de Alimentos; Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2011. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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109. | | BARROS, R. de A.; VITAL, C. E.; SILVA JÚNIOR, N. R.; VARGAS, M. A. S.; MONTEIRO, L. P.; FAUSTINO, V. A.; AUAD, A. M.; PEREIRA, J. F.; OLIVEIRA, E. E. de; RAMOS, H. J. O.; OLIVEIRA, M. G. de A. Differential defense responses of tropical grasses to Mahanarva spectabilis (Hemiptera: Cercopidae) infestation. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 93, n. 3, e20191456, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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110. | | SILVA, O. F. da; LANNA, A. C.; FERREIRA, C. M.; WANDER, A. E.; OLIVEIRA, M. G. de C.; SOARES, D. M.; NICOLI, C. M. L.; SANTIAGO, C. M.; BARRIGOSSI, J. A. F.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J. Desempenhos socioeconômico e ambiental da cultivar de feijão comum BRS Pontal. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 10., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. 1 CD-ROM. CONAFE.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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111. | | OLIVEIRA, M. G.; BRITO, J. R. F.; CARVALHO, R. R.; GUTH, B. E. C.; GOMES, T. A. T.; VIEIRA, M. A. M.; KATO, M. A. M. F.; RAMOS, I. I.; VAZ, T. M. I.; IRINO, K. Water Buffaloes (Bubalus bubalis) identified as an important reservoir of shiga toxin-producing Escherichia coli in Brazil. Applied and Environmental Microbiology, v. 73, n. 18, p. 5945-5948, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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112. | | COUTINHO, F. S.; RODRIGUES, J. M.; LIMA, L. L.; MESQUITA, R. O.; CARPINETTI, P. A.; MACHADO, J. P. B.; VITAL, C. E.; VIDIGAL, P. M.; RAMOS, M. E. S.; MAXIMIANO, M. R.; REIS, A. M. dos; OLIVEIRA, M. G. A.; FONTES, E. P. B.; RAMOS, H. J. de O. Remodeling of the cell wall as a drought-tolerance mechanism of a soybean genotype revealed by global gene expression analysis. aBiotech, v. 2, p. 14-31, 2021. Na publicação: Angela Mehta.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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113. | | OLIVEIRA, L. F. C. de; OLIVEIRA, M. G. de C.; WENDLAND, A.; HEINEMANN, A. B.; GUIMARÃES, C. M.; FERREIRA, E. P. de B.; QUINTELA, E. D.; BARBOSA, F. R.; CARVALHO, M. da C. S.; LOBO JUNIOR, M.; SILVEIRA, P. M. da; SILVA, S. C. da. Conhecendo a fenologia do feijoeiro e seus aspectos fitotécnicos. 2.ed.rev.ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2018. 61 p. il.Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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114. | | BARROS, J. D.; ARCOVERDE, G. F. B.; CARVALHO, A. C. F. de; VILA, A. J. T.; FAUSTINO, A. B.; MELO, A. A. de; VERAS, A. L.; MARTINS, C. S. G.; MELO, D. M. A. de; SANTOS, D. C. dos; VERDE, D. C. A. L.; TROVÃO, D. M. de B. M.; SILVA, E. S. da; SILVA, E. D. da C.; BARBOSA, E.; SILVA, F. G. C. da; ARAÚJO, H. F. P. de; MAIA, I. C.; SA, I. B.; RODRIGUES, J. de D.; CUNHA, J. E.; COSTA, J. D. da; CARVALHO, J. V.; LIMA, L. de C.; SANTOS, L. M. dos; ARAÚJO, L. N. de; COELHO, L. F. M.; VEIGA, M. E. B. da; ARAÚJO, M. C.; OLIVEIRA, M. G. de; MELO, M. G. P. de; GADELHA, M. A. da M. B.; SANTOS, M. C. dos; LIRA FILHO, P. de B.; LIMA, R. B. de; BATISTA, R. D.; OLIVEIRA, T. C. T. de; BEZERRA, U. A.; SOUZA, V. N. de. Processo participativo sobre degradação da terra em regiões do Semiárido brasileiro. São José dos Campos: SP, INPE, 2023. 53 p. il. color sid.inpe.br/mtc-m21d/2023/04.18.16.48-RPQBiblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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115. | | ANDRADE, B. O.; DRÖSE, W.; AGUIAR, C. A. de; AIRES, E. T.; ALVARES, D. J.; BARBIERI, R. L.; CARVALHO, C. J. B. de; BARTZ, M.; BECKER, F. G.; BENCKE, G. A.; BENEDUZI, A.; SILVA, J. B.; BLOCHTEIN, B.; BOLDRINI, I. I.; BOLL, P. K.; BORDIN, J.; SILVEIRA, R. M. B. da; MARTINS, M. B.; BOSENBECKER, C.; BRACCINI, J.; BRAUN, B.; BRITO, R.; BROWN, G. G.; BÜNEKER, H. M.; BUZATTO, C. R.; CAVALLERI, A.; CECHIN, S. Z.; COLOMBO, P.; CONSTANTINO, R.; COSTA, C. F. da; DALZOCHIO, M. S.; OLIVEIRA, M. G. de; DIAS, R. A.; SANTOS, L. A. dos; DUARTE, A. da F.; DUARTE, J. L. P.; DURIGON, J.; SILVA, M. E. da; FERREIRA, P. P. A.; FERREIRA, T.; FERRER, J.; FERRO, V. G.; FONTANA, C. S.; FREIRE, M. D.; FREITAS, T. R. O.; GALIANO, D.; GARCIA, M.; SANTOS, T. G. dos; GOMES, L. R. P.; GONZATTI, F.; GOTTSCHALK, M. S.; GRACIOLLI, G.; GRANADA, C. E.; GRINGS, M.; GUIMARÃES, P. S.; HEYDRICH, I.; IOP, S.; JARENKOW, J. A.; JUNGBLUTH, P.; KÄFFER, M. I.; KAMINSKI, L. A.; KENNE, D. C.; KIRST, F. D.; KROLOW, T. K.; KRÜGER, R. F.; KUBIAK, B. B.; LEAL-ZANCHET, A. M.; LOEBMANN, D.; LUCAS, D. B.; LUCAS, E. M.; LUZA, A. L.; MACHADO, I. F.; MADALOZZO, B.; MAESTRI, R.; MALABARBA, L. R.; MANEYRO, R.; MARINHO, M. A. T.; MARQUES, R.; MARTA, K. da S.; MARTINS, D. da S.; MARTINS, G. da S.; MARTINS, T. R.; MELLO, A. S. de; MELLO, R. L.; MENDONÇA JUNIOR, M. de S.; MORAIS, A. B. B. de; MOREIRA, F. F. F.; MOREIRA, L. F. B.; MOURA, L. de A.; NERVO, M. H.; OTT, R.; PALUDO, P.; PASSAGLIA, L. M. P.; PÉRICO, E.; PETZHOLD, E. S.; PIRES, M. M.; POPPE, J. L.; QUINTELA, F. M.; RAGUSE-QUADROS, M.; PEREIRA, M. J. R.; RENNER, S.; RIBEIRO, F. B.; RIBEIRO, J. R. I.; RODRIGUES, E. N. L.; RODRIGUES, P. E. S.; ROMANOWSKI, H. P.; RUSCHEL, T. P.; SACCOL, S. da S. A.; SAVARIS, M.; SILVEIRA, F. S.; SCHMITZ, H. J.; SIEGLOCH, A. E.; SIEWERT, R. R.; SILVA FILHO, P. J. S. da; SOARES, A. G.; SOMAVILLA, A.; SPEROTTO, P.; SPIES, M. R.; TIRELLI, F. P.; TOZETTI, A. M.; VERRASTRO, L.; ELY, C. V.; SILVA, Â. Z. da; ZANK, C.; ZEFA, E.; OVERBECK, G. E. 12,500+ and counting: biodiversity of the Brazilian Pampa Frontiers of Biogeography, v. 15, n. 2, e59288, 2023. 1948-6596Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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